身為領航的草根性穆斯林組織，台灣伊斯蘭團結協會自豪地推出嶄新且激勵人心的教育體系。台灣伊斯蘭團結協會的教育部分，主要目標是豐富穆斯林的視野，特別是穆斯林青年的生活、教育他們的思想，以健全的伊斯蘭教法—沙里亞（Shariah）潛移默化他們的心，從而引導他們深入體認伊斯蘭教作為人類普遍且永恆生活方式的認識。
台灣伊斯蘭團結協會提供《古蘭經》、聖訓、費格赫（Fiqh）、阿拉伯文、伊斯蘭歷史、伊斯蘭運動和類似主題的基本知識。本會致力讓穆斯林透過文字和行動，為伊斯蘭生活做好準備，並激勵他們發展自身的精神和智慧的力量。